根据“国中医药发［2007］51号文件”，全国的所有重点专科成立了23个协作组，和132个协作分组，并确定了协作组和协作分组的组长单位。其中肛肠病重点专科分组情况如下：

组长单位：南京市中医院

副组长单位：北京长青肛肠医院、辽宁中医药大学附属三院、中国医科大学附属第一医院、西安市中医院、北京广安门医院

在此基础上，根据肛肠科不同的重点病，产生了全国肛肠病分组协作单位：

直肠脱垂

组长单位：北京长青肛肠医院

副组长单位：呼伦贝尔市中蒙医院、北京中医药大学东直门医院

成员单位：山东中医药大学附属医院、湖南中医学院第二附属医院、西安市中医院、北京广安门医院

溃疡性结肠炎

组长单位：辽宁中医药大学附属第三医院

副组长单位：吉林市中西医结合肛肠医院、河南中医学院第一附属医院

成员单位：北京长青肛肠医院、唐山市中医院、漯河市中医院、郑州市大肠肛门病医院、西安市中医医院、银川市中医医院、北京中医药大学东直门医院

便秘

组长单位：南京市中医院

副组长单位：厦门市中医院、哈尔滨市中医院

成员单位：北京长青肛肠医院、唐山市中医院、山西中医学院第二中医院、辽宁中医药大学附属第三医院、吉林市中西医结合肛肠医院、临沂市中医院、河南中医学院第一附属医院、郑州市大肠肛门病医院、川北医学院附属医院

肛瘘

组长单位：西安市中医院

副组长单位：内蒙古自治区中蒙医医院、湖南中医学院第二附属医院、川北医学院附属医院

成员单位：山西中医学院第二中医院、呼伦贝尔市中蒙医院、中国医科大学附属第一医院、长春中医药大学附属医院、哈尔滨市中医院、齐齐哈尔市中医院、上海中医药大学附属龙华医院、南京市中医院、福建中医学院附属人民医院、厦门市中医院、临沂市中医院、来凤县民族医院、保山市中医医院、银川市中医医院

痔

组长单位：中国中医科学院广安门医院

副组长单位：上海中医药大学附属龙华医院、山东中医药大学附属医院

成员单位：山西中医学院第二中医院、内蒙古自治区中蒙医医院、长春中医药大学附属医院、漯河市中医院、来凤县民族医院、保山市中医医院、青海省中医院、北京中医药大学东直门医院

结直肠恶性肿瘤

组长单位：中国医科大学附属第一医院

副组长单位：唐山市中医院、湖南中医学院第二附属医院

成员单位：辽宁中医药大学附属第三医院、哈尔滨市中医院、南京市中医院、漯河市中医院、中国中医科学院广安门医院